Cuando era joven, Kakashi era una persona que seguía estrictamente las reglas.
glitter-graphics.comEste comportamiento se debía a que su padre, Sakumo Hatake, conocido como Colmillo Blanco de Konoha (y cuyo poder se decía comparable al de los sannin), fue deshonrado al abandonar una misión para salvar a sus compañeros, lo cual estaba fuera de las reglas de los ninjas. Una vez salvados sus compañeros, la misión fracasó y aquellos a los que había salvado le dieron la espalda.
glitter-graphics.comEl padre de Kakashi, después de una gran depresión y de la pérdida de su reputación, se suicidó a causa de esta.
Cuando Kakashi se acababa de convertir en jōnin, marchó junto a sus compañeros Rin y Obito, y su maestro Minato Namikaze a una misión. En el transcurso de ella, Kakashi comprendió por el comportamiento de Obito que lo que había hecho su padre era lo correcto. En esta misión, Obito, viéndose atrapado por una avalancha de rocas provocada por el enemigo, decidió entregar su recién adquirido Sharingan a Kakashi, ante su inminente muerte. Aparte del Sharingan,
glitter-graphics.commuchos toques de la personalidad de Obito parecen haber pasado a Kakashi, como llegar siempre tarde y dar una excusa irracional, cosas que antes eran impensables en él.
Kakashi nunca había aprobado a un grupo como maestro, hasta que se topa con el de Naruto, Sasuke y Sakura. Ellos demostraron poseer lo que él reconoce como un buen equipo: la capacidad de anteponer el bien de los compañeros a la consecución de la misión. En su primera misión fuera de Konoha, que consistía en proteger a Tazuna, un ciudadano del País de la Ola,

Kakashi y su equipo se enfrentan a dos grandes enemigos con los cuales no contaban: Zabuza y Haku. En su lucha contra el primero, muestra su Sharingan y su técnica original, el Chidori, en la cual logra derrotar a Zabuza y matar accidentalmente a Haku.
Después de esta misión, y tras las capacidades demostradas por sus alumnos, decidió proponerlos para participar en el examen de ascenso a chūnin, que se iban a celebrar en Konoha en breve.

Durante la prueba de supervivencia en el Bosque de la Muerte, Sasuke fue marcado con el Sello maldito de Orochimaru. Kakashi tuvo que realizar una técnica de sellado de urgencia para evitar que el sello tomara el control de su alumno, también mantuvo un breve enfrentamiento contra Orochimaru y Kabuto Yakuchi. Tras esta prueba, entreno a Sasuke y le enseñó el Chidori. Durante la invasión sufrida a manos de la Aldea Oculta de la Arena, Kakashi se quedó luchando cerca del Tercer Hokage.
Kakashi se reúne con Sakura y Naruto más de dos años después de la pérdida de Sasuke, tras realizar un breve entrenamiento, Akatsuki ataca la Aldea de la Arena y secuestra a Gaara. Kakashi participa en la misión para rescatar a Gaara de las manos de Akatsuki.
Antes de llegar son retenidos por un clon de Itachi Uchiha, que tras varias vicisitudes es derrotado por el Ōdama Rasengan de Naruto. Más tarde una vez el Shukaku es extraído de Gaara, Kakashi persigue junto a Naruto al Akatsuki que se lo ha llevado Deidara, muestra por primera vez su Mangekyō Sharingan éste pierde un brazo,
glitter-graphics.comy la gran explosión que crea no provoca daño a los ninjas de Konoha, puesto que Kakashi la envía a otra dimensión con esta técnica, finalmente Gaara es revivido por Chiyo y Deidara huye tras la muerte de Sasori. Tras el gasto de chakra que le supone usar esta técnica, queda incapacitado para moverse por sí mismo durante un tiempo, y es sustituído por Yamato como líder del equipo de Naruto y Sakura
Kakashi sumerge a Naruto tras su nueva derrota ante Sasuke en un entrenamiento acelerado para combinar su Rasengan con la naturaleza de su chakra, para ello y con la ayuda de Yamato
glitter-graphics.comy el Kage Bunshin no jutsu, trata de hacerle crear su propia técnica.
Cuando más tarde aparecen los miembros de Akatsuki Hidan y Kakuzu, combate contra este último junto a Ino y Chōji, y con la ayuda de Shikamaru consigue eliminar a Kakuzu dos de sus cinco corazones, mientras Naruto entrenaba con Yamato. Cuando la situación ya era insostenible y Kakashi estaba en serias dificultades, llegan Naruto,
glitter-graphics.comYamato, Sai y Sakura para ayudarles, Naruto logra derrotar fulminantemente a Kakuzu con su nueva técnica mientras que Shikamaru encierra bajo tierra a un desmembrado Hidan. Tras la actuación de Naruto, Kakashi se encarga de rematar a Kakuzu usando el raikiri.
Más tarde, Kakashi forma parte del grupo que Konoha lanza para encontrar a Itachi y Sasuke. Tras un breve encuentro entre Naruto, Yamato, Hinata y Kabuto Yakushi, todos se reúnen de nuevo tras el combate entre Sasuke Uchiha y Deidara, que termina con la muerte de este último en una gran explosión.
Desde ahí todo el grupo de Konoha parte en búsqueda del olor de Sasuke gracias a Kiba Inuzuka, tras dividirse el rastro de Sasuke y diseminarse Naruto con sus Kage Bunshin.
Todos son detenidos por Tobi, que repele los ataques de Naruto y fuerza a Kakashi a trazar un plan para derrotarlo mientras la batalla final entre Sasuke e Itachi tiene lugar. Ninguna de sus estrategias funciona para alcanzar a Tobi y Shino Aburame toma la iniciativa con su Hijutsu Mushidama, con el que logra alcanzar y drenar el chakra del Akatsuki, este no obsatnte se escabulle con una técnica espacio temporal que según Kakashi supera a la de Yondaime, una vez lo vuelven a localizar, este habla con Zetsu, que confirma la muerte de Itachi y el delicado estado de Sasuke, cuando los ninjas le interrogan, Tobi se encara a ellos, momento en el que Kakashi descubre el sharingan de su adversario.
Tras encontrarse con su Sharingan, Tobi abandona el lugar junto a Zetsu, Kakashi logra descubrir con su sharingan y la ayuda de Hinata el lugar del enfrentamiento de los Uchiha y todo el grupo se mueve rápidamente. Al encontrarse con el bosque incendiado con Amaterasu, Yamato usa su Mokuton y Kakashi su Mangekyō Sharingan para hacerlo desaparecer, cuando finalmente llegan a la escena, Tobi y Zetsu ya se han llevado al malherido Sasuke y el cadáver de Itachi respectivamente entonces